Laboratorija za sanitarni pregled namirnica, voda i predmeta opšte upotrebe; laboratorija za piogene infekcije, laboratorija za respiratorne infekcije; laboratorija za serološku dijagnostiku; laboratorija za genitalne infekcije; laboratorija za urinarne infekcije; laboratorija za crevne infekcije; laboratorija za serume i antigene; laboratorija za parazitološku dijagnostiku; laboratorija za mikološku dijagnostiku.
Predsednik Akreditacionog tela Srbije i Crne Gore JUAT dr Miloš Jelić 29.11.2005. god. uručio je direktorki Instituta za zaštitu zdravlja Srbije „Dr Milan Jovanović Batut” prim. dr Tanji Knežević rešenje o usklađenosti sa međunarodnim standardom JUS ISO/IEC 17025. Akreditacijom je Institut za zaštitu zdravlja Srbije „Dr Milan Jovanović Batut” dobio zvanično priznanje o kompetentnosti laboratorija na polju ispitivanja zdravstvene ispravnosti životnih namirnica, predmeta opšte upotrebe i voda i meteoroloških ispitivanja vazduha.